Искусственный интеллект открыл 360 тысяч скрытых «выключателей» в ДНК
Международная команда учёных, включая специалистов из Высшей школы экономики, создала уникальную карту ДНК-квадруплексов — временных структур, ответственных за активацию и деактивацию генов. Квадруплексы формируются из участков ДНК с высоким содержанием гуанина, сворачиваясь в сложные трёхмерные узлы. Эти структуры служат маркерами для белков, регулирующих генные функции, однако их кратковременное существование затрудняет традиционные методы картирования. Для решения этой проблемы учёные использовали искусственный интеллект, обучив модель DNABERT на базе EndoQuad, крупнейшей в мире коллекции подтверждённых квадруплексов. В результате удалось предсказать около 360 тысяч квадруплексов, что значительно превышает предыдущие достижения. Открытие показало, что квадруплексы действуют парами, формируясь в промоторах и энхансерах, что совместно регулирует генные экспрессии. Исследование, поддержанное грантом Центра ИИ-исследований ВШЭ, опубликовано в журнале Nucleic Acids Research.